ПЦР ребенку нужно сдавать. Количественный анализ не нужно, достаточно качественного анализа (т.е. просто "обнаружено" - "не обнаружено"). Учитывая, что ребенок грудной и ему, действительно, не прикажешь не есть, я бы сдавал анализ независимо от еды "как получится". Вероятность, что еда на что-то повлияет в таком случае, очень маленькая.